현재 가톨릭학생회는 '학교 가톨릭학생회'와 '센터 가톨릭학생회'로 나뉘어져 있다.
'학교 가톨릭학생회'는 학교에서 동아리 또는 계발활동 시간을 이용하여 가톨릭학생운동을 실천하고 있다.
그리고 '센터 가톨릭학생회'는 연합회 사무실이 있는 혜화동 가톨릭회관에서 가톨릭학생운동에 참여하고 싶은 학생들이 개별적으로 신청하여 활동하고 있다.

연합회에서는 현재 가입되어 있는 '학교 가톨릭학생회'뿐만 아니라 서울시내 모든 중고등학교에 가톨릭학생회가 신설될 수 있도록 노력하고 있다.
또한 학교와 본당에서 활동하기 어렵거나 다양한 체험을 경험하고자 하는 개인 회원에게 '센터 가톨릭학생회'에서 활동할 수 있도록 지원 하고 있다.
학교 가톨릭학생회 현황 센터 가톨릭학생회 현황
태랑중학교 셀
서울사대부여중 셀
성심여자중학교 샐
상명중학교 셀
보인중학교 셀
홍익사대부고 셀
하비에르 국제학교 셀피쉬 셀
하비에르 국제학교 프리셀
서울맹학교 인왕셀
성심여자고등학교 셀
동성고등학교 셀
계성여자고등학교
베드로 셀
야고보 셀